Patogen, czynnik chorobotwórczy – ciało obce, twór biologiczny lub mikroorganizm wywołujący chorobę u danego organizmu.^[1] Wyróżnia się następujące typy patogenów:

• ożywione (bakterie, grzyby, pasożyty, protisty),
• nieożywione (wirusy, priony)^{[potrzebny przypis]},
  • chemiczne (substancje żrące, toksyczne),
    • niedobory pokarmowe,
  • fizyczne (światło lasera, promieniowanie jonizujące, silne pole magnetyczne, mechaniczne).

Przykład patogenu biologicznego – wirus Ebola

Potwierdzenia, czy dany czynnik jest patogenem dla określonego taksonu, dokonuje się usiłując spełnić postulaty Evansa.

Zazwyczaj pojęcie to odnosi się do czynników biologicznych.

• patogeny roślin
• chorobotwórczość